Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Cish-201ENSMUST00000085102 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm40289-201ENSMUST00000201470 2268 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Sft2d1Q5SSN7 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Fes-201ENSMUST00000080932 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Gpr68-202ENSMUST00000110065 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Sft2d1Q5SSN7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms