Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbm27Q5SFM8 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms