Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp48Q3V0C5 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms