Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Obox3Q3UT54 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Obox3Q3UT54 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms