Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms