Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Usp19Q3UJD6 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usp19Q3UJD6 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms