Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gm10824-201ENSMUST00000220000 2198 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm16025-202ENSMUST00000161923 2425 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm12709-201ENSMUST00000149348 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 AC133598.5-201ENSMUST00000224937 1517 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 9630001P10Rik-202ENSMUST00000181335 3006 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ccbe1Q3MI99 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ccbe1Q3MI99 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ccbe1Q3MI99 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Olfr140-203ENSMUST00000216475 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Vash2-202ENSMUST00000166139 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Gm15496-201ENSMUST00000129578 2456 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Fkbp5-206ENSMUST00000177939 3844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Ggcx-201ENSMUST00000065906 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 4931406B18Rik-208ENSMUST00000191516 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccbe1Q3MI99 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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