Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Treml4Q3LRV9 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms