Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rundc1Q0VDN7 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rundc1Q0VDN7 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms