Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cntn3Q07409 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cntn3Q07409 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms