Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms