Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm26780-201ENSMUST00000180748 2495 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
GscQ02591 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
GscQ02591 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
GscQ02591 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
GscQ02591 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
GscQ02591 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm10531-201ENSMUST00000193527 2303 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
GscQ02591 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms