Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PrcdQ00LT2 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PrcdQ00LT2 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PrcdQ00LT2 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PrcdQ00LT2 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PrcdQ00LT2 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PrcdQ00LT2 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PrcdQ00LT2 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PrcdQ00LT2 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PrcdQ00LT2 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PrcdQ00LT2 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PrcdQ00LT2 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms