Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Mesp1P97309 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms