Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Otx2P80206 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
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