Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Otx1P80205 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Otx1P80205 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms