Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbdsP70122 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SbdsP70122 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms