Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tra2bP62996 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms