Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Dhtkd1-201ENSMUST00000026924 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Rpap2-201ENSMUST00000065422 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Vbp1P61759 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.2 ms