Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csrnp3P59055 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csrnp3P59055 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csrnp3P59055 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Csrnp3P59055 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csrnp3P59055 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Csrnp3P59055 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Csrnp3P59055 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Csrnp3P59055 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Csrnp3P59055 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Csrnp3P59055 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
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Csrnp3P59055 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Csrnp3P59055 Slc2a1-201ENSMUST00000030398 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 Mrpl32-202ENSMUST00000220621 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 Gm12592-201ENSMUST00000155332 2954 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 Zfp114-201ENSMUST00000086010 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 Usp10-202ENSMUST00000108988 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Csrnp3P59055 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Csrnp3P59055 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 Zbtb8b-202ENSMUST00000106046 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 Reep1-203ENSMUST00000212792 3339 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Csrnp3P59055 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Csrnp3P59055 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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