Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Hoxc13P50207 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms