Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms