Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CitP49025 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CitP49025 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms