Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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SrprbP47758 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrprbP47758 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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SrprbP47758 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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SrprbP47758 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SrprbP47758 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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SrprbP47758 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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SrprbP47758 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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SrprbP47758 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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SrprbP47758 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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SrprbP47758 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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SrprbP47758 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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SrprbP47758 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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SrprbP47758 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrprbP47758 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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