Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

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Length 298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NapbP28663 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NapbP28663 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NapbP28663 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NapbP28663 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms