Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Pde6aP27664 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Pde6aP27664 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pde6aP27664 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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