Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Hoxd12P23812 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms