Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ggta1P23336 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ggta1P23336 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ggta1P23336 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ggta1P23336 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Ggta1P23336 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Ggta1P23336 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Ggta1P23336 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Ggta1P23336 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Ggta1P23336 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Ggta1P23336 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Ggta1P23336 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms