Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Stk11ip-201ENSMUST00000027414 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Cd300a-201ENSMUST00000045151 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm9860-201ENSMUST00000211426 3653 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Pik3r4-210ENSMUST00000191268 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 2810029C07Rik-201ENSMUST00000180698 1954 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Svs1-201ENSMUST00000037696 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm37843-201ENSMUST00000195213 2639 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm10634-202ENSMUST00000188891 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 AC155270.1-201ENSMUST00000221626 4028 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Cdh23-203ENSMUST00000105462 10592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Nt5c1b-217ENSMUST00000219826 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Havcr1-202ENSMUST00000081819 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Zfp831-201ENSMUST00000059452 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Myh15-201ENSMUST00000168680 6340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Uvssa-201ENSMUST00000087864 7326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms