Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
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P10404 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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P10404 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
P10404 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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