Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
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PtprqP0C5E4 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
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PtprqP0C5E4 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
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PtprqP0C5E4 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Plec-203ENSMUST00000071869 14917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
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PtprqP0C5E4 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
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PtprqP0C5E4 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
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PtprqP0C5E4 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
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PtprqP0C5E4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprqP0C5E4 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 828.8 ms