Protein–RNA interactions for Protein: P01666

Ig kappa chain V-III region PC 7183, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01666 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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P01666 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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P01666 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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P01666 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01666 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
P01666 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
P01666 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01666 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01666 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01666 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01666 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01666 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01666 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01666 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01666 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01666 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01666 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01666 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01666 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01666 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01666 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01666 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01666 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01666 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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