Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ccl20O89093 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Ccl20O89093 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Ccl20O89093 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Ccl20O89093 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Ccl20O89093 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Ccl20O89093 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Ccl20O89093 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Ccl20O89093 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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