Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Lnx1O70263 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms