Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Gm15895-201ENSMUST00000157018 731 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Olfr523-202ENSMUST00000209314 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Lrit1-201ENSMUST00000120052 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Zfat-202ENSMUST00000160248 3866 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Padi3-202ENSMUST00000172098 3310 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Olfr517-202ENSMUST00000216500 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Erg-202ENSMUST00000113846 3249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Fam186b-201ENSMUST00000109100 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Gm43764-201ENSMUST00000202553 3172 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Vps45-201ENSMUST00000015891 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Trappc9-201ENSMUST00000023276 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Tmem248-201ENSMUST00000065329 3607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Mdga2-212ENSMUST00000222987 1388 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 2810407A14Rik-202ENSMUST00000189929 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Mterf4-203ENSMUST00000112944 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Rasgef1c-201ENSMUST00000063444 3378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Uhrf1-203ENSMUST00000113038 3483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Sgpl1-201ENSMUST00000092498 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Pgm2-202ENSMUST00000102783 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Olfr169-202ENSMUST00000215040 2316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Gcom1-204ENSMUST00000166843 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Zic4-201ENSMUST00000066384 3891 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Zfp229-201ENSMUST00000065871 4525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Rfx6-202ENSMUST00000122922 3464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Aftph-209ENSMUST00000177543 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Lyrm7os-201ENSMUST00000154044 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Apol7a-204ENSMUST00000176074 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Gm37446-201ENSMUST00000193015 4136 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Gm35725-201ENSMUST00000221862 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcshO08795 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms