Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms