Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Nit1-201ENSMUST00000111289 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Igf2bp2-202ENSMUST00000115379 3078 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gulo-201ENSMUST00000059970 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm35394-201ENSMUST00000196434 3252 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Lnpk-203ENSMUST00000111993 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Scrn3-201ENSMUST00000090811 3309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Ccrl2-201ENSMUST00000111888 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 B3gntl1-202ENSMUST00000067399 2864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Mmgt1-201ENSMUST00000059899 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm9866-205ENSMUST00000220998 1973 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Stard13-208ENSMUST00000202111 3373 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Dpy19l2-201ENSMUST00000133010 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm37671-201ENSMUST00000193198 2096 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm44597-202ENSMUST00000203287 3516 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Stk26-201ENSMUST00000033444 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Ephb4-205ENSMUST00000166239 3741 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 5330439K02Rik-201ENSMUST00000180953 2312 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Mfsd2b-204ENSMUST00000137337 2641 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm21969-201ENSMUST00000178644 4402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm43366-201ENSMUST00000199829 2655 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Cyp1a1-202ENSMUST00000216433 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Pla2g4e-201ENSMUST00000090071 4477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Tgfbi-201ENSMUST00000045173 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Ptrh2-202ENSMUST00000108022 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Rfx2-201ENSMUST00000002444 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Smim18J3QNP2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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