Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Zfp988F6VKC7 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms