Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc8E9PWG2 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 AC102327.1-201ENSMUST00000226389 742 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc8E9PWG2 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms