Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rnf217D3YYI7 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Itpripl1-202ENSMUST00000132773 3424 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rnf217D3YYI7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms