Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
PtprsB0V2N1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms