Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Cldn34c4A2ANA3 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms