Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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