Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Adgrd1-201ENSMUST00000056617 5163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Psma1Q9R1P4 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms