Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Nbdy-204ENSMUST00000185492 1346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm9864-201ENSMUST00000090043 1656 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 1700026D11Rik-205ENSMUST00000151417 789 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm20474-201ENSMUST00000180089 596 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Ly6c1-206ENSMUST00000188845 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm4866-201ENSMUST00000197408 589 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm9790-201ENSMUST00000054148 288 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm12637-201ENSMUST00000130501 368 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 4930538E20Rik-201ENSMUST00000131383 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm25154-201ENSMUST00000157123 119 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Col5a3Q9JLI2 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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