Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fndc8Q9D2H8 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Fndc8Q9D2H8 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms