Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Zbed3Q9D0L1 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms