Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Prpf19Q99KP6 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prpf19Q99KP6 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms