Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pacsin3Q99JB8 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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