Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hecw1Q8K4P8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Fam47e-205ENSMUST00000175974 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm17797-201ENSMUST00000182175 997 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Hecw1Q8K4P8 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Hat1-201ENSMUST00000028408 1576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 AC116596.1-201ENSMUST00000228112 1762 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Ighv14-3-201ENSMUST00000103469 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Hecw1Q8K4P8 Gm44173-201ENSMUST00000204316 132 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Olfr209-202ENSMUST00000208246 428 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Esp6-201ENSMUST00000097324 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm13547-202ENSMUST00000113810 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hecw1Q8K4P8 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms